MIỄN THUẾ THU NHẬP DOANH NGHIỆP TRONG VÒNG 3 NĂM DÀNH CHO DOANH NGHIỆP NHỎ VÀ VỪA KỂ TỪ KHI ĐƯỢC CẤP GIẤY CHỨNG NHẬN ĐĂNG KÝ DOANH NGHIỆP LẦN ĐẦU

Theo quy định, doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu sẽ được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong thời hạn 03 năm, kể từ thời điểm được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu. Thời gian miễn thuế được tính liên tục, bắt đầu từ năm đầu tiên doanh nghiệp được cấp giấy đăng ký, không phụ thuộc vào việc doanh nghiệp có phát sinh doanh thu hay lợi nhuận trong năm đó hay không. Trường hợp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp được cấp trước thời điểm Nghị quyết 198/2025/QH15 có hiệu lực thi hành mà còn thời gian áp dụng ưu đãi thì doanh nghiệp vẫn được miễn thuế TNDN theo quy định này cho thời gian còn lại. Nghị định 20/2026/NĐ-CP cũng nêu rõ những trường hợp không thuộc diện được miễn thuế TNDN tại điểm b khoản 3 Điều 7, nhằm ngăn chặn việc lợi dụng chính sách ưu đãi. Cụ thể, ưu đãi miễn thuế TNDN 3 năm không áp dụng đối với:

Thứ nhất, doanh nghiệp thành lập mới nhưng phát sinh từ việc sáp nhập, hợp nhất, chia, tách, chuyển đổi chủ sở hữu hoặc chuyển đổi loại hình doanh nghiệp.

Thứ hai, doanh nghiệp thành lập mới mà người đại diện theo pháp luật (trừ trường hợp người đại diện theo pháp luật không phải là thành viên góp vốn), thành viên hợp danh hoặc người có số vốn góp cao nhất đã tham gia hoạt động kinh doanh với vai trò là người đại diện theo pháp luật, thành viên hợp danh hoặc người có số vốn góp cao nhất trong các doanh nghiệp đang hoạt động hoặc đã giải thể nhưng chưa được 12 tháng tính từ thời điểm giải thể doanh nghiệp cũ đến thời điểm thành lập doanh nghiệp mới.

Thứ ba, các khoản thu nhập thuộc diện không được hưởng ưu đãi thuế, được quy định tại khoản 3 Điều 18 Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp năm 2025. Cụ thể là:

–        Thu nhập từ chuyển nhượng vốn, chuyển nhượng quyền góp vốn; thu nhập từ chuyển nhượng bất động sản, trừ thu nhập từ đầu tư xây dựng nhà ở xã hội để bán, cho thuê, cho thuê mua đối với các đối tượng được hưởng chính sách hỗ trợ về nhà ở xã hội theo quy định của Luật Nhà ở; thu nhập từ chuyển nhượng dự án đầu tư (trừ chuyển nhượng dự án chế biến khoáng sản), chuyển nhượng quyền tham gia dự án đầu tư, chuyển nhượng quyền thăm dò, khai thác, chế biến khoáng sản; thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh ở ngoài Việt Nam;

–        Thu nhập từ hoạt động tìm kiếm, thăm dò và khai thác dầu khí, tài nguyên quý hiếm khác và thu nhập từ hoạt động thăm dò, khai thác khoáng sản;

–        Thu nhập từ sản xuất, kinh doanh trò chơi điện tử trên mạng; thu nhập từ sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ thuộc đối tượng chịu thuế tiêu thụ đặc biệt theo quy định của Luật Thuế tiêu thụ đặc biệt, trừ dự án sản xuất, lắp ráp ô tô, máy bay, trực thăng, tàu lượn, du thuyền, lọc hóa dầu;

Việc miễn thuế TNDN trong 3 năm đầu được đánh giá là chính sách hỗ trợ thiết thực, giúp doanh nghiệp nhỏ và vừa, đặc biệt là doanh nghiệp khởi nghiệp, giảm áp lực tài chính, có thêm nguồn lực để tái đầu tư, mở rộng sản xuất – kinh doanh và nâng cao khả năng cạnh tranh trong giai đoạn đầu hoạt động. Tuy nhiên trong cùng một thời gian, nếu doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo, công ty quản lý quỹ đầu tư khởi nghiệp sáng tạo, tổ chức trung gian hỗ trợ khởi nghiệp đổi mới sáng tạo, doanh nghiệp nhỏ và vừa đồng thời đủ điều kiện hưởng nhiều chính sách miễn, giảm thuế khác nhau, thì được lựa chọn hưởng chính sách có lợi nhất và phải thực hiện ổn định trong suốt thời gian ưu đãi theo khoản 4 Điều 7 Tức nếu doanh nghiệp nói trên đã lựa chọn chính sách mình cho là có lợi nhất thì phải áp dụng xuyên suốt, không được đổi giữa chừng.

Trường hợp kỳ tính thuế đầu tiên có thời gian hoạt động được miễn, giảm thuế dưới 12 tháng, thì doanh nghiệp được lựa chọn hưởng ưu đãi ngay từ kỳ đầu hoặc đăng ký với cơ quan thuế thời điểm bắt đầu ưu đãi từ kỳ tính thuế tiếp theo theo khoản 5 Điều 7. Cụ thể, nếu doanh nghiệp hoạt động trong năm đầu chưa đủ 12 tháng mà không đăng ký với cơ quan thuế để chuyển thời gian bắt đầu ưu đãi qua kỳ thuế tiếp theo (tức sang năm tiếp theo liền kề), thì doanh nghiệp sẽ mặc nhiên được áp dụng ưu đãi cho thời gian mà doanh nghiệp đã hoạt động, thời gian đó sẽ được tính là kỳ tính thuế đầu tiên.